脚趾的灰指甲大多由足癣直接传播：手指灰指甲则可能从手癣传播或由经常抓足而感染。指灰指甲在足趾比手指更多见。指灰指甲多由其他丝状真菌、酵母样菌及酵母菌等引起，大多见于营养不良的指甲，现已肯定白念珠菌及短帚真菌可致指灰指甲。
真菌对药物的不敏感也是诱发灰指甲的原因之一，处于休眠状态的病原真菌体对一般抗真菌药物根本无反映，而且真菌休眠的潜伏期较长。一旦用药停止，气温湿度等环境合适，真菌孢子便会萌发、生长、繁殖，从而导致灰指甲的发生。
因脚气真菌导致重复感染性，在大多数情况下，先因有了脚气而后继发灰指甲，也有一些病例是由于灰指甲以而导致脚气或手癣，这也是灰指甲的原因。真菌生命力极其顽强，许多灰指甲患者治疗一段时间认为灰指甲治好后就没再继续坚持用药了，实际上，真菌还是有一些没有杀灭干净，这小部分真菌一旦在条件适宜的情况会再次滋生发作，导致灰指甲久治不愈。因此，这是导致灰指甲的原因之一。
当指甲受到真菌感染后，易导致灰指甲的发生。质地增厚、粗糙，色泽干枯、混浊这就是灰指甲。通过长期内服、外用抗真菌药物，可以治愈。预防措施重于注意手部卫生，积极治疗手足癣，防止通过毛巾、鞋、袜、脚盆、擦脚巾等等物体的传染。这是引起灰指甲的原因中比较常见的一种。
引起灰指甲的原因有很多，不能认为指甲有病都是甲癣。灰指甲患者的甲癣的发病往往从一个指(趾)甲开始，而后逐渐波及其他(趾) 甲。如果十个手指甲或脚趾甲同时发病，则往往是全身性疾病的一种表现。
