鼻腔内炎症治愈困难细菌一旦进入鼻腔的鼻窦内，就极易存留繁殖。加上鼻窦口小，鼻腔黏膜与鼻窦黏膜口处黏膜肿胀，使鼻窦口阻塞，出于鼻窦的生理特点，致使药物难进入其中。这是常见的引起过敏性鼻炎复发的原因。
耐药性长期以来，医学界针对过敏性鼻炎的治疗一直停留在快速解除症状上，使用一些普通的鼻炎药物，只能暂时性地改变鼻腔通气状况，过敏性鼻炎症状也只是因为药物的原因暂时性消失，而对消除炎症没有太大作用，一旦停用，就会再次发作;因药物滥用，使病菌随着过敏性鼻炎一次又一次的发作;一次又一次的用药和更换药，病菌不断地变异而具有耐药性，到一定程度时，使用一般药物根本无法作用病菌，从而使过敏性鼻炎越来越难治。
抵抗力、免疫力低下，很多过敏性鼻炎患者本身体质差，抵抗力和免疫力低下，略受风寒或外源因素的诱发就会发作。
外源因素的诱发，随着社会的日益发展，空气污染的加剧，化学过敏源的增多，细菌病毒变异，精神紧张，气候的恶化等因素，使感冒多发且迁延难愈，从而使过敏性鼻炎的发病率逐年上升，越发难治。
有哮喘或过敏鼻炎家族史的小儿,发生过敏鼻炎的风险较普通人群高出2-6倍,发生哮喘的风险高出3-4倍。多数患儿先是出现鼻炎,而后发生哮喘;少部分患儿先是有哮喘,然后出现鼻炎;或是二者同时发生。可见过敏鼻炎和哮喘的发病具有明显的相关性。
